新會地處北緯22°5′15″～22°35′01″和東經112°46′55″～113°15′43″之間，位于廣東省中南部，珠江三角洲西南部，西江、潭江下游。東與中山市、東南與珠海市斗門區毗鄰，南瀕南海，西南與臺山市、西與開平市、西北與鶴山市相接，北與蓬江區、江海區相連。地呈三角形，北闊南窄，東西相距48.8千米，南北相距54.5千米。2012年，全區土地面積1354.71平方公里。
新會地表顯露地層，自老至新主要有寒武系八村群、泥盆系、白堊系、下第三系、第四系全新統，其中以第四系全新統地層分布最廣，出露面積898.19平方公里，占全市總面積的54.72%。火成巖分布廣泛，多為燕山旋回的巖漿巖。區內褶皺屬華南褶皺系的一部分，構造不大發育，有新會背斜、杜阮向斜、睦洲向斜。斷層形成發育在寒武系、中泥盆統、白堊紀地層及燕山三、四期巖體中，其中北西300°方向斷裂規模最大，由睦洲、大鰲往東南延至斗門，往西北延至鶴山、四會，長度大于170公里。新會地勢自西北向東南傾斜。丘陵山地主要分布在區境西北、西南部，面積882525畝，占全區總面積的35.84%，有大雁山地、圭峰山地、古兜山地、牛牯嶺山地。其中古兜山主峰獅子頭海拔982米，是全區最高峰。平原主要分布在區境東南、中南、中西部，顯示海灣沉積特征，面積107.19萬畝，占全區總面積的43.53%，有海灣沖積平原、三角洲沖積平原、山谷沖積平原。全區水域面積507930畝，占全區總面積的20.63%。
新會山地主要分布在市境西北、西南部，面積882525畝，占全區總面積的35.84%，有大雁山、圭峰山、古兜山地、牛牯嶺山。
古兜山：距新會城區62公里，群山連綿百里。建國前，這里被作為土匪巢，被害者多為華僑、僑眷，建國后，興辦林場、茶場、果園、造林綠化。辟山辦電，耗資1400萬元，共建成水庫11座，水電站17座。主峰獅子頭海撥982米，行政區劃屬古兜水電站指揮部?！爸笓]部”位于古兜山地西南部，西界臺山，東連崖南，是以主峰古兜山為中心的高山區。東南3公里有馬山，高程350米。西北1.5公里有大磅山，高程909米。南距5.5公里有古兜山主峰獅子頭，高程982米。東南距3公里有劉三姝山，高程831米。大磅山東3公里有大園嶺，高程756米。南折3公里有將軍山，高程629米。又4公里至紅婆山西坡，這一帶現筑有水庫5個，建電站10座，集雨面積50000畝。山地全部封育次生林，保持保持水土，涵蓄水源。
圭峰山：位于新會境內的西北部，峰巒起伏，綿亙數十里，東接江門市區，南與城區（會城）相鄰，西接大澤鎮，北至杜阮鎮。海拔442米。因山形酷似圭璧，故稱“圭峰山”相傳隋唐時，山上多桂樹，又有“桂嶺”之名；其頂方圓如臺，亦稱“玉臺山”。遠望圭峰，蒼翠欲滴；進入圭峰，綠蔭如蓋，“圭峰疊翠”，已成為新會的新八景之首。1989年，被定為省級首批風景名勝區。1997年，國家林業部批復圭峰山為國家級“森林公園”面積55.1平方公里。
圭峰山是廣東的十大名山之一，自古便是名儒碩彥的講學之地，高僧羽客的練真之所，宋代大文豪蘇東坡曾到圭峰游覽題詩；明代大畫家沈石田曾到此作《玉臺圖》；明代著名的理學家陳白沙曾在圭峰山講學；明末兵部尚書黃公輔退官后曾在圭峰山修身養性并聚眾抗清，今在山上仍留有黃公輔墓和紀念他的寺廟；唐代黃巢、明朝黃蕭養兩次農民起義，都曾在圭峰山上安營扎寨，今仍有點將臺太師座、練兵場等遺址可尋。
大雁山地：盤亙在縣境西北，主峰大雁山，海拔308米。
牛牯嶺山地：在縣境東西，主峰牛牯嶺，海拔398米。